如何建立和使用補充醫療保險基金？這是很多人所關注的問題。與基本醫療保險相比，補充醫療保險包括企業補充醫療保險、商業醫療保險、社會互助保險和社區醫療保險。是基本醫療保險的有力補充，是多層次醫療保險體系的重要組成部分。
與基本醫療保險不同，補充醫療保險不是由國家立法強制執行的，而是由雇主和個人自愿參加的。單位和職工參加統一的基本醫療保險后，由單位或個人根據需求和可能原則，適當增加醫療保險項目，來提高保險保障水平的一種補充性保險。
基本醫療保險與補充醫療保險不是矛盾的，而是相輔相成、不可替代的。他們的目的是為員工提供醫療保障。
企業事業單位在參加基本醫療保險的基礎上，在職工個人賬戶用完、個人自給自足達到一定數額后，應當為醫療補貼建立補充醫療保險，補充醫療保險基金按照職工工資總額的2% - 4%計提，從成本中列支。